Auch der Tourismus hat Bedeutung für das operative Geschäft von Niedersachsen Ports. Insbesondere die Inselhäfen leisten einen eigenen Beitrag zur Entwicklung des Tourismus in der Region.

So gehören zum unmittelbaren Geschäftbereich der Niederlassung Norden die Inselversorgungshäfen Norddeich (Ausgangshafen der Fährlinie nach Norderney und Juist) sowie Bensersiel (Ausgangshafen der Fährlinie nach Langeoog) und die Inselhäfen Norderney, Norddeich, Baltrum, Langeoog, Spiekeroog und Wangerooge . Hinzu kommen die Unterhaltungsbaggerungen in der Hafenzufahrt des gemeindeeigenen Hafens Juist sowie der Betrieb und die Unterhaltung verschiedener Hafeneinfahrtsfeuer.

Mit rund 1 Mio.t Umschlag, deutlich mehr als 7,5 Mio. Personenbeförderungen, rd. 80.000 Schiffsbewegungen stellt die durchschnittliche jährliche Bilanz der 14 Küsten- und Inselhäfen zwischen Greetsiel und Harlesiel, zwischen Borkum und Wangerooge einen wesentlichen Wirtschaftsfaktor in der Region Ostfriesland dar.

Fährverkehr und Inselversorgung, Fischerei und Sportschifffahrt lasten die Häfen besonders in den Sommermonaten bis an ihre Kapazitätsgrenze aus. Dabei ist jeder Hafen aufgrund seiner individuellen Besonderheiten Anziehungspunkt für den Fremdenverkehr und teilweise Ausgangspunkt für den Fährverkehr bzw. die Inselversorgung zu den ostfriesischen Inseln. Damit leisten die Häfen einen wichtigen Beitrag zur Sicherung und Stärkung der Wirtschaftskraft in der niedersächsischen Küstenregion.